国际首个一串红基因组图谱发布

 近日，英国牛津大学主办的科学期刊《大数据科学》在线刊登了题为《重要观赏植物一串红的高质量参考基因组组装》的研究论文，在国际上首次公布一串红基因组图谱绘制工作。

 在植物基因组学研究领域，这不仅是国际权威机构正式发布的国际首个一串红基因组图谱，也是国内首个观赏植物基因组图谱。项目由北京市园林科学研究院和北京林业大学合作完成。

 一串红（Salvia splendens）隶属唇形科鼠尾草属，是一类极具经济价值的观赏植物。其花色艳丽、适应性强、易栽培养护，在世界各地广泛应用于花坛、花境以及花海、大地景观营造等。

 该项研究对“奥运圣火”一串红的两个单株进行了PacBio Single-Molecule Real-Time（SMRT）测序，获得了808M的一串红高质量全基因组序列；采用contigs和scaffolds（2个基因组序列片段）长度分布评价指标，对一串红和已报道的其他唇形科植物薄荷、丹参基因组进行比较，结果表明，本次研究中获得的一串红基因组质量远高于其他两类唇形科植物；进化分析表明，一串红和同属鼠尾草属的传统药用植物丹参出现分化的时间，大约在2821万年前。

 同时，实验针对收集到的一串红资源进行分析，采用转录组测序技术，探讨了一串红资源呈现不同花色性状的调控机制。